Umeå Plant Science Centre (UPSC) är världsledande inom växtfysiologi och skogsgenetik, där forskningen producerar stora mängder data som kräver bioinformatiks resurser och mjukvaror för analys. UPSC är ett samarbete mellan UmU:s institution för fysiologisk botanik och SLU:s institution för skoglig genetik och växtfysiologi. Inom SLU finns det fram till årsskiftet 2026/2027 en universitetstäckande infrastruktur som erbjuder stöd inom bioinformatik: SLU Bioinformatics Infrastructure (SLUBI). Inför avvecklingen av SLUBI kommer en tjänst inom bioinformatik att tillsättas vid UPSC bioinformatikplattform (UPSCb). UPSCb är en del av bioinformatikmiljön i Umeå, som till största delen är samlokaliserad med UPSC, med mer än trettio personer som arbetar för både lokala och nationella (till exempel SciLifeLab NBIS) enheter.
I din roll på UPSC:s bioinformatikplattform (UPSCb) kommer du att ge stöd och service inom bioinformatik till forskargrupper och delta i olika typer av projekt. Arbetet består av att hantera flera projekt samtidigt. Projekten är korta (några månader) och kräver ofta ett nära samarbete med biologer. För att säkerställa att dataanalysen som utförs i plattformen håller hög standard kommer du att varannan vecka delta i bioinformatiska seminarier och en gång i veckan vara involverad i plattformens studiesessioner. Plattformen stöder deltagande i kurser och workshops för vidareutbildning men är även involverad i att leverera sådana kurser på lokal och nationell nivå. Du kan förvänta dig att arbeta med korta utmanande projekt i en stödjande och livlig arbetsmiljö, och så småningom vara den som ansvarar för analysen av flera projekt.
Vi söker dig med doktorsexamen inom beräkningsbiologi, bioinformatik eller motsvarande. Du borde vara väl bekant med Unix/Linux och minst ett programmeringsspråk såsom Python, R, C eller C++. Du behöver ha en god samarbetsförmåga samt mycket goda kunskaper i engelska. UPSC är en internationell miljö och jobbet kräver en god förmåga att interagera med biologer (UPSCb’s huvudsakliga användargrupp). UPSCb erbjuder även användarstöd, i vissa fall under en längre tidsram och mer omfattande projekt, vilket gör tidigare erfarenhet av handledning och undervisning meriterande. Eftersom du kommer att vara en viktig del av UPSC bioinformatikplattformen, som är en liten enhet med fem anställda, erfordras en mycket god förmåga att självständigt organisera och rapportera arbetet.
Du kommer att arbeta med andra experter inom plattformen och i bioinformatikmiljön som oftast är högt specialiserade inom en viss teknologi, till exempel RNA-Seq, metagenomik eller epigenetik. Det är därför meriterande med erfarenhet av processering och integrering av multi-omikdata (till exempel genomik, transkriptomik, proteomik och metabolomik). Även populationsrelaterade projekt är vanliga, vilket gör det meriterande med erfarenhet av helgenomstudiee och eQTL-kartläggning.
UPSC består av två institutioner som tillhör två universitet, Umeå universitet (
Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, SLU, Umeå.
Vikariat 12 månader
100%
Enligt överenskommelse.
senast 2026-09-01.
