Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi är en del av Umeå Plant Science Centre (UPSC,
Nu söker vi en Bioinformatiker inom forskningsdatahantering och AI/ML till Wallenberg Initiative for Forest Research (WIFORCE) datasupportcenter!
Wallenberg Initiative for Forest Research (WIFORCE) datasupportcenter (DSC) söker en engagerad dataanalytiker som vill delta i banbrytande datadriven forskning och hjälpa WIFORCE-forskare att utveckla nästa generation av verktyg baserade på artificiell intelligens och/eller maskininlärning (AI/ML) för skogsbruk. Du kommer att vara knuten till institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi men arbeta i alla avdelningars intresse som är involverade i WIFORCE och dess DSC. Du kommer att vara placerad inom bioinformatik- och datavetenskapsmiljön i Umeå, som finns vid Umeå Plant Science Centre (UPSC).
Som dataanalytiker vid DSC fungerar du som en central länk mellan WIFORCE DSC, dess dataförvaltare, de inbäddade dataförvaltarna vid fem institutioner på SLU samt WIFORCE-forskare. Du bidrar till lösningar över organisationsgränser genom att dra nytta av FAIR-forskningsdata som kuraterats och annoterats av dataförvaltningsteamet, för att hjälpa WIFORCE-forskare att utveckla och implementera lösningar som besvarar tvärvetenskapliga frågor, oftast med hjälp av ML och AI.
Den huvudsakliga arbetsuppgiften är att ge stöd inom datavetenskap, särskilt att hjälpa WIFORCE-anslutna forskargrupper med utveckling och implementering av AI/ML, samtidigt som du deltar i olika typer av projekt. Projekten är korta (några månader) och kräver ofta nära samarbete med forskarteam med varierad bakgrund, som täcker alla vetenskapliga områden vid SLU:s skogsfakultet (från genomik till skogsmaskiner). För att säkerställa hög kvalitet i dataanalysen deltar du i seminarier inom bioinformatik varannan vecka. DSC stödjer deltagande i kurser och workshops för vidareutbildning och är även involverat i att hålla sådana kurser lokalt och nationellt. Du kan förvänta dig att arbeta med korta, utmanande projekt i en stödjande och dynamisk arbetsmiljö och så småningom ansvara för analyser i flera projekt. En annan viktig del av arbetet är att ta fram undervisningsmaterial och hålla workshops för att utbilda forskare (de flesta är doktorander) i både datahantering och analys. Arbetet innefattar deltagande i lokala, nationella och internationella projekt.
Arbetsuppgifterna inkluderar, i nära samarbete med ett team av dataförvaltare och en systemutvecklare, att utnyttja innehållet i forskningskatalogen i DSC:s system för vetenskaplig datahantering till fullo. Systemet underhålls av teamets systemutvecklare och omfattar bland annat behörighetsstyrning, dataarkivering, metadataregistrering och dataöverföring. Medan dataförvaltningsteamet främst fokuserar på att finjustera systemet för att optimera hela datalivscykeln och systemutvecklaren ansvarar för backend-verktygen, förväntas du bidra med värdefull återkoppling till båda. Detta sker dels genom interaktion med WIFORCE-forskare, där du bidrar till att definiera rätt uppsättning metadata för att öka datanyttan genom förbättrad interoperabilitet, dels genom att etablera rutiner för användarstöd och utbildning i användningen av systemet för vetenskaplig datahantering. Du ska säkerställa att data, som kan vara av känslig natur, lagras korrekt och säkert samt att åtkomsten kontrolleras på rätt sätt. Arbetsuppgifterna kan därför även innefatta att leda och samordna arbete i olika projekt samt att delta i kompetenshöjande nätverk inom forskningsdatahantering och AI/ML-analys på lokal och nationell nivå.
Vi söker dig som har en doktorsexamen inom beräkningsbiologi, bioinformatik eller motsvarande erfarenhet och kompetens som kan bedömas likvärdig.
Du ska:
- vara väl insatt i Unix/Linux och minst ett programmeringsspråk såsom Python, R, Fortran, C eller C++
- vara bekant med AI/ML och något av ramverken för djupinlärning, såsom PyTorch, TensorFlow, Keras eller JAX
- kunna visa att du arbetar enligt goda datavetenskapliga principer (säkerställa rådatas oföränderlighet, använda virtuella miljöer, strukturerade arbetsflöden samt dokumentera och versionshantera kod)
- ha god samarbetsförmåga och mycket goda kunskaper i engelska, både i tal och skrift, eftersom UPSC är en internationell miljö och arbetet kräver samarbete med forskarteam och forskningsingenjörer
- ha mycket god förmåga att självständigt planera, organisera och redovisa arbete, då du kommer att vara en viktig del av DSC, som är en liten enhet med nio medarbetare
Det är meriterande att ha kompetens och kunskap inom:
- statistik (särskilt kopplat till ML)
- erfarenhet av arbete med verktyg för vetenskaplig datahantering (t.ex. SDA, REMS, Rucio)
- arbete i HPC-miljöer och användning av köhanteringssystem
- arbete med känsliga data
- dokumentation och ledning av samarbetsprojekt
- erfarenhet av att bearbeta och integrera data från flera källor, då du kommer att arbeta med andra experter inom centret och i bioinformatikmiljön som ofta är högt specialiserade inom en viss teknik eller datatyp, såsom genomik, geografiska informationssystem (GIS) eller fjärranalys
Dessutom är det meriterande att kunna kommunicera på svenska, med tanke på den lokala arbetsmiljön.
Slutligen kommer stor vikt att läggas vid egen kompetensutveckling. Även om vi säkerställer att tid avsätts för detta, ansvarar du själv för strategin, i linje med den föränderliga arbetsmiljön och utvecklingen av dina arbetsuppgifter.
UPSC består av två institutioner som tillhör två universitet, Umeå universitet (
Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi, SLU, Umeå
Tillsvidareanställning. SLU kan komma att tillämpa provanställning.
100%
2026-09-01 eller enligt överenskommelse.
senast 2026-08-07.
Din ansökan ska vara skriven på svenska eller engelska och innehålla:
- Ett personligt brev på max 2 A4-sidor som motiverar ditt intresse för denna anställning och som förklarar varför du är den person som ska anställas. Brevet bör också innehålla en diskussion om din erfarenhet och syn på systemdrift.
- En meritförteckning.
- Kontaktuppgifter till minst två referenspersoner (inga referensbrev krävs).
- Dokumentation av formella meriter (examensbevis, kursutdrag, kursintyg etc.).
- Dokumentation av tidigare befattningar, relevanta erfarenheter och andra kvalifikationer.
- Referenser (länkar) till allmänt tillgängliga utvecklingsprojekt och repositories du varit en del av.
Wallenberg Initiatives in Forest Research (WIFORCE) är ett grundvetenskapligt forskningsprogram som ökar förståelsen för processerna bakom skogars tillväxt, överlevnad och biologiska mångfald. Kunskapen kan bidra till hållbart skogsbruk, nya skötselmetoder och klimatanpassade träd.
Forskningsprogrammet är en strategisk satsning på naturvetenskaplig skogsforskning vid Sveriges lantbruksuniversitet (SLU), finansierad av Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse.
WIFORCE bygger vidare på två starka forskningsprogram – ett om framtidens skogsskötsel och ett inom skogsbiologi och bioteknik – och växer nu med flera nya delar. En central satsning är forskarskolan, där över 50 doktorander utbildas, varav 16 i samverkan med industri och andra aktörer. Inom programmet etableras också fem nya forskargrupper med spetskompetens för att möta framtidens utmaningar. Dessutom planeras nya arenor för samarbete och innovation – verktyg för framtidens brukande och bevarande av skog.
Just nu pågår planering för ett stort nationellt datacenter – en avancerad plattform för att hantera och analysera komplexa skogsdata.
Här kombineras data från fältarbete, genetik, klimatmodeller och AI för att utveckla nya verktyg för hållbar användning och bevarande av skogar i framtiden.
Ambitionen är att skapa en öppen resurs som kan gynna forskare, myndigheter och industri.
Institutionen för skoglig genetik och växtfysiologi är en del av Umeå Plant Science Centre (UPSC,
Umeå Plant Science Centre (UPSC)
Umeå Plant Science Centre (UPSC) bildades 1999 när institutionen för växtfysiologi vid Umeå universitet och institutionen för skogsgenetik och växtfysiologi vid Sveriges lantbruksuniversitet (SLU) gick samman för att skapa en stark gemensam forskningsmiljö. UPSC är en av de starkaste forskningsmiljöerna för experimentell växtbiologi och skogsbioteknik i Europa och vi bedriver forskning av både grundläggande och strategisk betydelse. Forskningen vid UPSC täcker ett brett spektrum av discipliner inom växtbiologi, inklusive ekologi, genetik, fysiologi, biokemi, cellbiologi och molekylärbiologi. Det gemensamma målet för forskarna inom UPSC är att förstå de mekanismer som driver växters utveckling och anpassning till miljöförändringar. Vårt arbete utförs på alla organisationsnivåer i växten och genom att integrera de olika forskningsområdena och expertområdena. Vi strävar efter att beskriva växten som en komplex organism i dynamisk interaktion med sin omgivning.
